Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CACNA1DQ01668 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms