Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
IFITM3Q01628 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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