Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VLDLRP98155 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms