Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
RPL23P62829 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
RPL23P62829 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
RPL23P62829 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms