Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ACTA2P62736 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms