Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COPZ1P61923 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms