Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERVPABLB-1P60509 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms