Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
FAM3BP58499 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms