Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAD23AP54725 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms