Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNB3P54284 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB3P54284 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB3P54284 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB3P54284 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB3P54284 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB3P54284 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB3P54284 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNB3P54284 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB3P54284 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB3P54284 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNB3P54284 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms