Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRPC1P48995 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRPC1P48995 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms