Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMPOP42166 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMPOP42166 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMPOP42166 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMPOP42166 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMPOP42166 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMPOP42166 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms