Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFSF9P41273 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF9P41273 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF9P41273 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF9P41273 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF9P41273 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF9P41273 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF9P41273 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF9P41273 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFSF9P41273 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms