Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGDSP41222 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms