Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MDH1P40925 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MDH1P40925 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MDH1P40925 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms