Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIPAP38571 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIPAP38571 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIPAP38571 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIPAP38571 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIPAP38571 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIPAP38571 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIPAP38571 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIPAP38571 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIPAP38571 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIPAP38571 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LIPAP38571 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LIPAP38571 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIPAP38571 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIPAP38571 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIPAP38571 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIPAP38571 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIPAP38571 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LIPAP38571 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LIPAP38571 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms