Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ATP6V1E1P36543 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms