Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACTN2P35609 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms