Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THBS4P35443 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THBS4P35443 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
THBS4P35443 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THBS4P35443 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THBS4P35443 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
THBS4P35443 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THBS4P35443 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THBS4P35443 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
THBS4P35443 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THBS4P35443 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THBS4P35443 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THBS4P35443 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THBS4P35443 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
THBS4P35443 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
THBS4P35443 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms