Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTNNB1P35222 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CTNNB1P35222 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms