Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GTF2E2P29084 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GTF2E2P29084 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms