Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD34P28906 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD34P28906 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD34P28906 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD34P28906 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CD34P28906 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD34P28906 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD34P28906 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD34P28906 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD34P28906 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD34P28906 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD34P28906 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD34P28906 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CD34P28906 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CD34P28906 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CD34P28906 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD34P28906 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD34P28906 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CD34P28906 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CD34P28906 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CD34P28906 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CD34P28906 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms