Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PSMB9P28065 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms