Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PSMA1P25786 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PSMA1P25786 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms