Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5F1P24539 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms