Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTPCP11686 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms