Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CHGAP10645 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CHGAP10645 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHGAP10645 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHGAP10645 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHGAP10645 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHGAP10645 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHGAP10645 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHGAP10645 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CHGAP10645 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHGAP10645 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHGAP10645 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHGAP10645 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms