Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HKR1P10072 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HKR1P10072 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HKR1P10072 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HKR1P10072 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HKR1P10072 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HKR1P10072 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HKR1P10072 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HKR1P10072 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HKR1P10072 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HKR1P10072 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HKR1P10072 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HKR1P10072 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HKR1P10072 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HKR1P10072 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HKR1P10072 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HKR1P10072 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HKR1P10072 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HKR1P10072 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HKR1P10072 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HKR1P10072 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HKR1P10072 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HKR1P10072 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HKR1P10072 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HKR1P10072 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HKR1P10072 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HKR1P10072 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HKR1P10072 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
HKR1P10072 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HKR1P10072 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HKR1P10072 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HKR1P10072 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HKR1P10072 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HKR1P10072 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
HKR1P10072 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
HKR1P10072 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms