Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ITGA5P08648 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms