Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CDK1P06493 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CDK1P06493 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms