Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
OPN1SWP03999 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms