Protein–RNA interactions for Protein: P01213

PDYN, Proenkephalin-B, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDYNP01213 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDYNP01213 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDYNP01213 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PDYNP01213 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms