Protein–RNA interactions for Protein: O94993

SOX30, Transcription factor SOX-30, humanhuman

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX30O94993 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SOX30O94993 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SOX30O94993 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SOX30O94993 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SOX30O94993 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SOX30O94993 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX30O94993 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SOX30O94993 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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