Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF254O75437 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms