Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PPFIA4O75335 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms