Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CTDSP2O14595 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CTDSP2O14595 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP2O14595 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP2O14595 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP2O14595 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP2O14595 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP2O14595 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
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CTDSP2O14595 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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CTDSP2O14595 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP2O14595 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CTDSP2O14595 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CTDSP2O14595 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CTDSP2O14595 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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CTDSP2O14595 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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CTDSP2O14595 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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