Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
E2F3O00716 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F3O00716 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F3O00716 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms