Protein–RNA interactions for Protein: F6WH68

RTEL1-TNFRSF6B, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms