Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PCH4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PCH4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PCH4 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PCH4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
E9PCH4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PCH4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PCH4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PCH4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PCH4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PCH4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PCH4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PCH4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PCH4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PCH4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PCH4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PCH4 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PCH4 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PCH4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
E9PCH4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
E9PCH4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
E9PCH4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E9PCH4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
E9PCH4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
E9PCH4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
E9PCH4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
E9PCH4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E9PCH4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
E9PCH4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
E9PCH4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
E9PCH4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
E9PCH4 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
E9PCH4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms