Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PATL2C9JE40 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms