Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
SMIM1B2RUZ4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SMIM1B2RUZ4 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms