Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SRRM4A7MD48 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SRRM4A7MD48 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SRRM4A7MD48 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SRRM4A7MD48 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SRRM4A7MD48 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SRRM4A7MD48 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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