Protein–RNA interactions for Protein: A6NJU9

NPIPB13, Nuclear pore complex-interacting protein family member B13, humanhuman

Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB13A6NJU9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NPIPB13A6NJU9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB13A6NJU9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms