Protein–RNA interactions for Protein: A6NH52

TVP23A, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23AA6NH52 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TVP23AA6NH52 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms