Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PKP3Q9Y446 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms