Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC8Q9Y2L5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms