Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
TTF2Q9UNY4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TTF2Q9UNY4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms