Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNX6Q9UNH7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNX6Q9UNH7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms