Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
BRPF3Q9ULD4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
BRPF3Q9ULD4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms