Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PADI1Q9ULC6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PADI1Q9ULC6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms